Prefekt har flera betydelser:

1. Chef för en akademisk institution. Prefekten har där till uppgift att leda det löpande arbetet och verkställa institutionsstyrelsens beslut. En vice prefekt kallas proprefekt.
2. Högre fransk befattningshavare, den som är chef för en prefektur. Motsvarar en landshövding i Sverige.
3. En prefekt (latin praefectus, av praeficere) var en person med en ledande funktion i Antikens Rom. Exempelvis Praefectus praetorio, Praefectus urbis, Praefectus castrorum.

Romerska titlar | Präfekt | Prefect | Prefekto | Prefekt (Vana-Rooma) | Préfet | Prefekt | Префект