種牡馬(しゅぼば)とは繁殖用の牡馬のこと。
サラブレッドやアングロアラブなど、競走馬として主に用いられる種の場合、競馬開催の根本に優秀な種を選別するという目的があることから、基本的に競走成績優秀馬が種牡馬になるが、競走成績が優秀でなくとも、活躍馬の近親など血統が優れていれば種牡馬になることも多い。
成績優秀であるからといっても必ず良い産駒が生まれるということは無い。競走馬時代は大活躍したオグリキャップが引退後種牡馬となったが、スターホースということで当時は話題となり種付けの申し込み数も多かった。しかし産駒の成績が非常に悪く、近年は勝ち馬どころかその血を持つ馬ですら見ることは珍しい。
逆に全く成績の伴わなかった馬が種牡馬として大成することもある。日本では競走に出走することすら叶わなかったエイシンサンディが父サンデーサイレンスという血統から、高額なサンデーサイレンスを種付けできない生産者から請われ種牡馬となる。その産駒であるミツアキサイレンスがダート交流重賞で活躍、エイシンテンダーが桜花賞トライアルのチューリップ賞を制覇するなどしている。エイシンサンディのように血統だけで種牡馬になったような馬は、普通であれば種付けの申込み数はそこまで多くなく、毎年デビューする競走馬は数少ない。
ちなみに日本国内の種牡馬の総頭数は1991年には600頭を超えていたが、その後の景気低迷、さらには地方競馬におけるアラブレースの廃止縮小の影響を受け、2004年には320頭あまりにまで落ち込んでいる。
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