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生物の分類（せいぶつのぶんるい）: この項目では生物を統一的に階級分類する方法を説明する。分類学、学名、Category:分類学、メインページも参照のこと。

判明している生物の種は、300万～1,000万種である。それぞれの種には学名（属名＋種名）がつけられる。学名の前半は属名で、属とはごく類縁関係が近い種をまとめたものである。これらを分類してその分類グループに分類名をつけることが行われている。さらにこの分類を階層的に（小分類＞中分類＞大分類etc）体系付けすることで、いろいろな生物グループ同士の類縁関係、ひいては進化の系譜を明らかにしようとする。

アリストテレスの分類

どのような分類体系が合理的かは、アリストテレス以来さまざまな工夫がされ、案がだされてきた。 彼の『動物の発生』では動物分類は次のようになる。
  1. 有血動物
    1. 胎生
      1. 人類
      2. 胎生四足類
      3. 鯨類
    2. 卵胎生
      1. 軟骨魚類
    3. 卵生
      1. 鳥類
      2. 卵生四足類
      3. 無足類
    4. 不完全卵生
      1. 魚類
  2. 無血動物
    1. 不完全卵生
      1. 軟体類
      2. 軟殻類
    2. 蛆生あるいは自然発生
      1. 有節類
    3. 無性生殖または自然発生
      1. 殻は類
      2. その他
アリストテレスの権威が絶対とされた中世は、この動物分類が支配的であった。

リンネの分類

近代的な分類法の刷新はリンネから始まった。 以下では現時点で生物分類でほぼ一般的に使われている分類体系フレームを記述する。
※ 分類体系はこれまでに述べたように、あくまでも人が扱いやすくするための人為的なものである側面があることに注意すること。
※ 近年では、さまざまな分野で伝統的な分類体系を系統学の知見を反映させた体系に組替える動きが盛んである。

和名英名 例：ヒト 例：ローズマリー 例：エノキタケ
界:Kingdom: 動物界植物界菌界
門:Phylum/Division: 脊索動物門
(脊椎動物亜門） 		被子植物門 担子菌門
綱:Class: 哺乳綱双子葉植物綱菌じん綱
目:Order: サル目シソ目ハラタケ目
科:Family: ヒト科シソ科キシメジ科
属:Genus: ヒト属
Homo		 ローズマリー属
Rosemarinus		 エノキタケ属
Flammulina
種:Species: sapiensofficinalisvelutipes

  • 門は、動物界はPhylum、植物界、菌界はDivisionと使い分ける。
  • 中間的分類が必要なときの階級名は、その分類単位よりも上位の分類には、大(Megn-)・上(super-)を、下位の分類には、亜(sub-)・下（infra-）・小(Parv-)などの接頭語を各階級の頭につけて生成させる。
  • Subfamily(亜科)とGenus(属)の間をさらに細分する必要があるときは、Tribe(族)を使う。
  • Subgenus(亜属)とSpecies(種)の間をさらに細分する必要があるときは、Section(節)を使う。

分類名の接尾辞

属より上位の分類名には、以下の表のとおり、規則的な接尾辞が付けられている。

　
分類単位
Taxon
植物
Plant
藻
Alga
菌
Fungi
動物
Animal
門 Division/Phylum -phyta -phyta -mycota 　
亜門 Subdivision/Subphylum -phytina -phytina -mycotina 　
綱 Class -opsida -phyceae -mycetes 　
亜綱 Subclass -idae -phycidae -mycetidae 　
目 Order -ales -ales -ales
亜目 Suborder -ineae -ineae -ineae
上科 Superfamily -acea -acea -acea -oidea
科 Family -aceae -aceae -aceae -idae
亜科 Subfamily -oideae -oideae -oideae -inae
族 Tribe -eae -eae -eae -ini
亜族 Subtribe -inae -inae -inae -ina

上記の語尾は命名規約で指定されている物であるが、動物についてはある分類大系（鳥類のSibley分類体系）が自主的に下記のような独自の共通語尾を設定している。

　
分類単位
鳥類
上目 Superorder -morphae
目 Order -iformes
亜目 Suborder -i
下目 infraorder -ides
小目 Parvorder -ida
上科 Superfamily (-oidea)
科 Family (-idae)
亜科 Subfamily (-inae)
族 Tribe (-ini)
亜族 Subtribe (-ina)

ただし、なにぶん限定された分類群に対して一部の分類大系が独自に行っていることでもあり、他の分野にはほとんど影響を与えていないようである。

界による分類

生物分類の階層構造の最上位は界(Kingdom)である。 この界は古代から伝統的に二界（植物界、動物界）に分けられてきたが、近代に微生物の知見が高まってくると、三界、五界、八界に分ける説などが登場してきた。

二界説

リンネが定めた分類法で生物を動物界(動いて餌を採るもの)、と植物界(動物ではないもの)の2界に分類したものである。

三界説

19世紀に入り、ヘッケル(Ernst Heackel)は動物とも植物ともとれる原始的な生物を3番目の生物界、原生生物界として分離し、動物界、植物界、原生生物界の三界とした。

五界説

ホイタッカー(Robert H. Whittaker)の提唱した分類法で、現在の主流となっている。 細胞核を持たない原核生物をモネラ界として、カビ、キノコなどを菌界として新たに分離し、モネラ界、原生生物界、植物界、菌界、動物界の五界とした。

六界説

五界説のモネラ界をさらに細胞の特性で細菌界、古細菌界に分けたもの。

八界説

現在の系統分類学成果を取り入れつつ、五界説のわかりやすさを残した八界説が提唱されている。 八界説では生物を古細菌界、真正細菌界、アーケゾア界、原生動物界、クロミスタ界、植物界、菌界、動物界に分類する。

三つのドメイン

近年、微生物の研究から界より上位に階層ドメイン（超界）を設定する仮説が提案されている。

これは、細胞の構成で（動物界、植物界、原生生物界などが含まれる）真核生物、細菌、古細菌として分ける説である。

各界の関連

ヘッケル
（1894年）
三界説		 ホイタッカー
（1959年）
五界説		 ウーズ
（1977年）
六界説		 ウーズ
（1990年）
三つのドメイン
原生生物界 モネラ界 細菌界 細菌（バクテリア）
古細菌界 古細菌（アーキア）
原生生物界 原生生物界 真核生物（ユーカリア)
植物界 菌界 菌界
植物界 植物界
動物界 動物界 動物界

一般的分類例

原核生物(=モネラ界)

真核生物

原生生物界

植物界

菌界
動物界

分子系統学的分類例

20世紀後半から勃興した、タンパク質のアミノ酸配列や核酸の塩基配列決定法の技術、そしてそのデータを用いて系統の類縁関係を推定する解析手法の進展に伴って、従来の生物系統分類法は大きな変革を迫られている。特に、これまで他のグループに所属させることができないために一括りに分類されていた、原生生物や藻類、一部の菌類につき系統が大幅に見直されつつある。学問上は二界説ないし五界説は既に瓦解したと言っても過言ではない。ここではカヴァリエ＝スミス(Thomas Cavalier-Smith)らが中心となって提唱している分子系統学的分類の一例を示す（ただし現生生物のみ）。従来の界、門、綱との整合性は今後の課題である。この分野は現在さらに進展しつつあるため、今後も大小の変更があり得る。

原核生物

核膜無し、環状染色体、細胞骨格・原形質流動無し、70Sリボソーム、有糸分裂無し

真核生物

核膜有り、線状染色体、細胞骨格・原形質流動有り、80Sリボソーム、有糸分裂有り
  • バイコンタ(Bikonta) 2本鞭毛を持つ真核生物（退化により持たないものも有り）
    • 植物（狭義、一次植物）(Plantae) 一次共生により葉緑体を獲得した真核生物の直系の子孫、板状ミトコンドリアクリステ、葉緑体包膜が2重
    • 盤状クリステ類(Discicristatae) 盤状ミトコンドリアクリステ、エクスカヴェートに含める意見有り
      • ユーグレノゾア(Euglenozoa) 例：ユーグレナ植物、キネトプラスト類
      • ヘテロロボサ(Heterolobosea) 例：ナエグレリア類、アクラシス類
      • ジャコバ類(Jacobea)ミトコンドリアクリステは板状
    • エクスカヴェート(Excavates) 細胞腹側に深くえぐれた捕食装置を有する真核生物の一群
      • マラウイモナス(Malawimonas) 盤状クリステ類の可能性あり
      • トリコゾア類(Trichozoa) 例：ディプロモナス類、レトルタモナス類、パラバサリア類
      • アネロモナス類(Anaeromonada) 例：オキシモナス類
    • ストラメノパイル(Stramenopiles) 中空の鞭毛小毛を有する真核生物の一群、アルヴェオラータを含めてクロマルヴェオラータ(Chromalveolata)とする意見有り
      • 無殻太陽虫類(Actinophryida)
      • オパリナ類(Opalozoa)
      • ラビリンチュラ類(Labyrinthista)
      • ビコソエカ（ビコエカ）類(Bicosoecales、Bicoecales)
      • プラシディア類(Placididea)
      • デヴェロパエラ(Developayella)
      • 卵菌類(Oomycetes) 例：ツユカビ類、ミズカビ類
      • サカゲツボカビ類(Hyphochytriomycetes)
      • 不等毛植物類（黄色植物類）(Heterokontophyta,Chromophyta) 例：褐藻類、珪藻類
    • アルヴェオラータ(Alveolata) 細胞膜直下に扁平な小胞を有する真核生物の一群
    • リザリア(Rhizaria) 分子情報による類縁、アメーバ状生物が多いが全てに共通する形態的特性は無い
      • レタリア(Retaria) 例：有孔虫類、放散虫類、一部の太陽虫類
      • ケルコゾア(Cercozoa) 例：ケルコモナス類、クロララクニオン植物、ネコブカビ類、ユーグリファ類
    • 所属不明
      • クリプト植物(Cryptophyta) 独立の界とする研究例有り
      • ハプト植物(Haptophyta) 植物に近縁とする研究例有り
      • アプソゾア類(Apusozoa)
      • 有中心粒類(Centrohelida) バイコンタとアメーボゾアの間に位置するという研究例有り
  • ユニコンタ(Unikonta) 1本鞭毛を持つ真核生物（真菌類は退化して鞭毛を持たない）
    • アメーボゾア(Amoebozoa) 分子情報による類縁、真核生物の最も原始的な系統、アメーバ状生物が多い（アメーボゾアとバイコンタを統合してアンテロコンタ(Anterokonta)とする説有り）
      • 葉状仮足類（ロボサ）(Lobosa) 例：アメーバ類
      • コノサ(Conosa) 例：変形菌、タマホコリカビ類、アカントアメーバ類、エントアメーバ類、ペロビオンタ類
    • オピストコンタ(Opisthokonta) 鞭毛を後方にして運動する真核生物
      • 菌類(Fungi) 例：子嚢菌類、担子菌類、微胞子虫類
      • メソミセトゾア(Mesomycetozoa) 例：イクチオスポラ類
      • コアノゾア(Choanozoa) 例：襟鞭毛虫類
      • 後生動物(Metazoa) 例：海綿動物、刺胞動物、脱皮動物（線形動物、節足動物）、冠輪動物（扁形動物、環形動物、軟体動物）、後口（新口）動物（棘皮動物、半索動物、脊索動物）

関連項目

分類学 | 生物

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