Mycota

Le règne des mycota (fungi ou encore mycètes) n'est autre que celui des champignons.

Dans la langue française, le mot champignon peut prêter à confusion. En effet, ce que nous appelons couramment champignon (le plus souvent muni d'un pied et d'un chapeau) n'est qu'une sorte de fruit, plus exactement un sporophore (appareil portant les spores et permettant la reproduction, terme aujourd'hui préféré à « carpophore »), particulièrement développé, le reste du champignon (le mycélium) étant souterrain et donc invisible. Mais il existe bien d'autres champignons tels que les rouilles, les levures, les moisissures ou encore certains parasites de l'homme. Leurs points communs sont exposés ci-dessous. Après avoir longtemps été classés parmi les végétaux, dont ils ne partagent que peu de caractéristiques (en l'occurrence l'immobilité), ils appartiennent aujourd'hui au règne des Fungi.

Caractéristiques générales

Sont classés dans le règne des Fungi tous les organismes remplissant les conditions suivantes :

Ils sont eucaryotes (organismes possédant des cellules munies d'un noyau).
Ils sont hétérotrophes vis-à-vis du carbone, qu'ils doivent donc trouver dans leur environnement immédiat.
Ils sont absorbotrophes, se nourrissant par absorption. Dans la nature, seulement 2% des "fungi" se nourrissant par absorption. 98% ont recours à la mycorhize, une symbiose entre les racines d'une plante et le mycélium (pas de racines). Les racines de la plante produisent le glucose (du sucre) pour le champignon, celui-ci ne sachant pas le produire lui-même (manque de chlorophylle). Le mycélium procure en retour de l’eau et des sels minéraux inaccessibles aux racines de l’arbre.
Ils développent un appareil végétatif appelé mycélium constitué de filaments appelés hyphes.
Ils se reproduisent par des spores.
Ces spores sont non flagellées ou à un seul flagelle (caractéristique faisant que le mildiou, à deux flagelles, n'est plus aujourd'hui considéré comme un champignon).
Ils ont une paroi cellulaire chitineuse, ce qui les apparente plus aux animaux qu'aux végétaux, dont la paroi est cellulosique.
Ils stockent leurs réserve sous la forme de glycogène.

Classification

Historique

Les champignons ont été classés dans le passé comme faisant partie du règne végétal du fait de la présence d'une paroi cellulaire et de plusieurs similitudes entre leurs cycles de reproduction et ceux des algues. En 1969 Whittaker les a classés dans un règne à part celui des "Mycota" sur la base de plusieurs caractères particuliers comme l'absence de chlorophylle et d'amidon.

Une des classifications les plus répandues est celle d'Ainsworth dans son "Dictionary of Fungi" (1971), bien qu'elle soit aujourd'hui profondément remaniée on la trouve encore dans certains ouvrages.
Classification d'Ainsworth :

Règne des Fungi
- Division des Myxomycota (présentent des plamodes)
  - - Acrasiomycetes
    - Myxomycetes
    - Plasmodiophoromycetes
- Division des Eumycota (ne présentent pas de plasmode)
  - Subdivision des Mastigomycotina (présentent des spores mobiles -zoospores-)
    - Chytridiomycetes
    - Hyphochytridiomycetes
    - Oomycetes
  - Subdivision des Deuteromycotina
  - Subdivision des Zygomycotina
  - Subdivision des Ascomycotina
  - Subdivision des Basidiomycotina

Ce premier règne des champignon comprenait un certain nombre d'organismes qui, par la suite, ont été replacés dans d'autres règnes :

Les Oomycètes et les Hyphochytridiomycètes qui sont maintenant classés dans les Straménopiles.
Les Myxomycota qui sont maintenant classés dans plusieurs groupes de protistes.

Classification "traditionnelle"

La classification actuelle des champignons distingue cinq divisions (ou embranchements) :

Chytridiomycota, ou chytridiomycètes : espèces aquatiques dont les spores portent un flagelle. On les considère comme les ancêtres de tous les autres champignons.
Zygomycota, ou zygomycètes : espèces à spores non flagellées dont les cellules ne sont pas séparées par des cloisons.
Ascomycota, ou ascomycètes : les spores sont produites à l'intérieur de sacs (les asques) et sont projetées, à maturité, à l'extérieur par ouverture de l'asque.
Basidiomycota, ou basidiomycètes : les spores se développent à l'extrémité de cellules spécialisées (les basides) et sont dispersées par le vent à maturité.
Glomeromycota, autrefois classés dans les Zycomycota ils sont maintenant considérés comme constituant une division à part.

La Classification systématique des champignons

Les premières études des chromosomes tendent à proposer une nouvelle classification: La classification systématique des champignons coïncide donc de plus en plus avec la classification phylogénique

Morphologie

Le champignon est un thallophyte, c'est-à-dire qu'il ne possède ni feuilles, ni tiges, ni racines. Son appareil végétatif, ou thalle, est constitué de cellules allongées qui peuvent se présenter de deux façons:

elles sont cloisonnées et articulées entre elles, et sont alors appelées hyphes (c'est le cas le plus fréquent);
il n'y a pas de cloison les séparant les unes des autres. On parle alors de structure coenocytique et de siphon.

On précisera que, si la plupart des champignons sont pluricellulaires, il y a quand même des exceptions notables : ainsi les levures sont unicellulaires. Lorsqu'on a affaire à des hyphes, ceux-ci s'associent pour former des filaments constituant le mycélium. Pour se reproduire, les champignons génèrent des cellules appelées spores. Au moment de la reproduction, la plupart des champignons dits « supérieurs » (classification aujourd'hui abandonnée) développent un appareil particulier appelé sporophore (on dit aussi carpophore), portant l'hyménium. C'est ce sporophore, souvent constitué d'un pied et d'un chapeau, que nous appelons communément champignon. Les champignons « inférieurs » peuvent aussi produire des sporophores, mais ceux-ci demeurent microscopiques.

Nourriture et environnement

Grâce à leur chlorophylle, la plupart des végétaux peuvent fixer le gaz carbonique de l'air par photosynthèse. On dit qu'ils sont autotrophes. Ce n'est pas le cas des champignons, hétérotrophes, qui doivent se débrouiller comme ils peuvent pour se procurer le carbone nécessaire à leur vie. Ils exploitent pour cela leur environnement immédiat, absorbant les matières organiques de trois façons différentes:

Les champignons saprophytes exploitent la matière organique morte ou en décomposition (feuilles mortes, débris végétaux ou animaux, excréments).
Les champignons parasites exploitent la matière organique vivante, qu'il s'agisse de végétaux, d'animaux (y compris les hommes) ou même d'autres champignons.
D'autres champignons préfèrent la symbiose, association avec un végétal autotrophe, chacun des deux organismes tirant profit de cette association. La symbiose permet parfois de créer des êtres nouveaux, comme les lichens. Cette symbiose s’appelle mycorhize.

Usages

La plupart des catégories de champignons sont utilisées à des fins alimentaires, notamment en fricassée ou en omelette.
Ils contiennent souvent des molécules organiques très complexes.

La pénicilline et de nombreux médicaments sont tirés de champignons.

D'autres peuvent avoir des vertus psychotropes (voir l'article détaillé Champignon hallucinogène). Ils contiennent des substances psychédéliques.

Les champignons cultivés

Si la culture des champignons est attestée dès l'Antiquité, peu d'espèces, malgré les différents progrès réalisés au cours du siècle, se révèlent intéressantes pour une culture de type industriel ou semi-industriel. La plus grosse part du marché est occupée par le champignon de Paris (Agaricus bisporus), ainsi que par des champignons asiatiques tels que le shiitaké ou champignon noir (Lentinula edodes). La culture des champignons est appelée la myciculture (à ne pas confondre avec la mycoculture, une technique de culture utilisée en mycologie pour les mycètes d'intérêt médical ou vétérinaire).

Principales espèces cultivées

Agaricus bisporus — champignon de Paris
Pleurotus ostreatus — pleurote en huître, et autres espèces voisines de pleurotes
Agrocybe aegerita — pholiote du peuplier
Lentinula edodes — shiitake
Auricularia auricula-judae — oreille de Judas
Volvariella volvacea — volvaire asiatique
Pholiota nameko — pholiote asiatique

Production

Il s'agit de champignons alimentaires sans distinction d'. Production en tonnes. Chiffres 2003-2004
Données de FAOSTAT (FAO)

Chine

1309455

42 %

1359335

42 %

États-Unis d'Amérique

391000

12 %

391000

12 %

Pays-Bas

263000

8 %

260000

8 %

France

165647

5 %

170000

5 %

Pologne

120000

4 %

120000

4 %

Espagne

115165

4 %

115165

4 %

Italie

90000

3 %

90000

3 %

Canada

78018

2 %

80000

2 %

Royaume-Uni

77100

2 %

80000

2 %

Irlande

69000

2 %

70000

2 %

Japon

67000

2 %

67000

2 %

Autres pays

403726

13 %

404238

13 %

Total

3149111

100 %

3206738

100 %

Bibliographie

Régis Courtecuisse, Bernard Duhem : Guide des champignons de France et d'Europe (Delachaux & Niestlé, 1994-2000).
Marcel Bon : Champignons de France et d'Europe occidentale (Flammarion, 2004)
Dr Ewaldt Gerhardt: Guide Vigot des champignons (Vigot, 1999) - ISBN 2-7114-1413-2
Roger Phillips: Les champignons (Solar, 1981) - ISBN 2-263-00640-0
Thomas Laessoe, Anna Del Conte: L'Encyclopédie des champignons (Bordas, 1996) - ISBN 2-04-027177-5
Peter Jordan, Steven Wheeler: Larousse saveurs - Les champignons (Larousse, 1996) - ISBN 2-03-516003-0
G. Becker, Dr L. Giacomoni, J Nicot, S. Pautot, G. Redeuihl, G. Branchu, D. Hartog, A. Herubel, H. Marxmuller, U. Millot et C. Schaeffner: Le guide des champignons (Reader's Digest, 1982) - ISBN 2-7098-0031-4
Henri Romagnesi: Petit atlas des champignons(Bordas, 1970) - ISBN 2-04007940-8
Larousse des champignons édition 2004 sous la direction de Guy Redeuilh- ISBN 2-03-560338-2

Liens internes

Articles de Wikipédia concernant les champignons :

Agaric, Amanite (Amanite citrine, Amanite épaisse, Amanite des Césars, Amanite panthère, Amanite rougissante, Amanite solitaire, Amanite tue-mouches, Amanite vireuse), Ascomycète, Asque, Baside, Basidiomycète, Bolet (Bolet à pied rouge, Cèpe, Cèpe de Bordeaux, Cèpe d'été), Chanterelle, Clitocybe géotrope, Clitocybe nébuleux, Chytridiomycète, Cloque, Coprin, Coprin blanc et noir, Girolle, Helvelle crépue, Helvelle lacuneuse, Hydne, Hyménium, Lactaire velouté, Lépiote, Lépiote déguenillée, Levure, Lichen, Meunier, Moisissure, Morille, Mycélium, Mycologie, Oïdium, Oreille de Judas, Oronge, Pézize, Polypore aplani, Polypore du bouleau, Polypore écailleux, Psilocybe, Russule (Russule charbonnière, Russule verdoyante), Spore, Strophaire vert-de-gris, Trompette des morts, Truffe, Vesse-de-loup, Zygomycète.

Voir aussi :

Catégories :

Liens externes

Voir un schéma détaillé d'un Champignon
Atlas des champignons, véritable encyclopédie des champignons
Le memento des champignons
Société Mycologique de France
ChampYves le site aux mille champignons
Le projet Tree of life (en anglais)
Vegetauxland
Champignons De Franche-Comté
Société Mycologique du Nord de la France Site assez complet sur les Champignons et leur étude.