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Un organisme est dit saprophyte s'il est capable de se nourrir de matière organique en décomposition. Le saprophytisme est le fait de vivre en saprophyte. Les micro-organismes saprophytes vivent dans l'environnement (eau, air, sol) sans dépendre d'un autre être vivant. Ils se nourissent donc de matières organiques en décomposition et la transforment en matière minérale. Ils jouent donc un rôle capital dans les cycles de la matière (cycle du carbone, de l'azote).

De nombreux champignons se développent selon ce mode de nutrition et poussent sur des arbres ou des feuilles mortes. Ils participent ainsi à la formation de l'humus.

Quand il s'agit de plantes supérieures, celles-ci sont généralement dépourvues de chlorophylle. Les plus connues sont Neottia nidus-aviset l'orobanche.

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