Les mycorhizes (du grec myco ; champignon et rhiza ;racine) sont des champignons qui forment une association symbiotique avec les racines d'une plante. Dans cette association, les hyphes d’un champignon colonisent les racines d’une plante. Les hyphes sont la partie souterraine, de forme filamenteuse, qui constituent l’équivalent des racines d’une plante pour les champignons.
Dans cette relation de symbiose, les champignons mycorhiziens aident la plante à obtenir des sels minéraux présent dans le sol (principalement le Phosphore et l'azote), tout en la protégeant d’attaques d’autres organismes pathogènes. Plusieurs études ont démontrées que sans la présence d’un champignon symbiotique, la plante poussera plus lentement et sera beaucoup plus susceptible d’être la victime d’une infection. En retour, le champignon reçoit de la plante de la matière organique (sucres) essentielle à sa survie. Le mycelium formé des réseaux d’hyphes souterrains augmente énormement la surface d’absorption et ainsi permet à la plante d’avoir accès aux nutriments présents dans le sol qui sinon seraient en trop petite concentration pour être utilisés par la plante.
Il y a deux types principaux de mycorhizes : Les endomycorhizes et les ectomycorhizes.
Les endomycorhizes (aussi appelé champignons mycorhiziens à arbuscules), portent leur nom du fait qu’ils forment des structures en forme d’arbustes microscopique à l’intérieur même de la cellule de la plante. Il ne pénètre cependant pas le protoplaste de la cellule mais invagine la membrane plasmique de celle-ci. Cela a pour effet d’accroître la surface de contact entre l'hyphe et la cellule de la plante et ainsi faciliter l’échange de métabolites entre les deux partenaires.
Les endomycorhize sont formé uniquement par un champignon de la division des Glomeromycètes. Ils sont typiquement associé avec les plantes herbacées, mais peuvent aussi coloniser des plantes ligneuses.
Les endomycorhizes colonisent environ 80 % des plantes vasculaires terrestres, c'est-à-dire plus de 350 000 espèces. Il existe cependant moins de 200 espèces de champignons endomycorhiziens. Donc, ces champignons ne sont pas très spécifiques dans leurs relations de symbiose. N’étant pas très spécifique, chaque espèce doit possède un énorme potentiel d'adaptabilité et une large diversité génétique afin de lui permet de s’adapter aux différentes conditions environnementales auxquelles il doit faire face. Ils se reproduisent uniquement asexuellement. Ils sont aussi unique au point de vue génétique puisque leurs spores possèdent plusieurs noyaux génétiquement différents *.
Les ectomycorhizes ne pénetrent pas à l’intérieur de la paroi cellulaire de la plante, mais entourent simplement les racines.
Ils sont typiquement formé par un champignon de la division des Basidiomycète, Ascomycète, ou Zygomycète et les racine d’une plante ligneuse.
Les plantes fesant partie de l’ordre des Ericales et de la famille des Orchidacées forment aussi des mycorhizes. Ces associations, plus rares, sont cependant differentes des deux formes précédemment mentionnée.
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