Le métabolisme est l'ensemble des transformations moléculaires et des transferts d'énergie qui se déroulent de manière ininterrompue dans la cellule ou l'organisme vivant. C'est un processus ordonné, qui fait intervenir des processus de dégradation (catabolisme) et de synthèse organique (anabolisme). On peut y distinguer le métabolisme de base et le métabolisme en activité.
L'anabolisme est le métabolisme qui permet à la cellule de synthétiser les substances indispensables à sa vie et à sa fonction. Cette synthèse s'effectue à partir des matériaux que la cellule a absorbés du milieu extérieur et de l'énergie dégagée par le catabolisme ou provenant de l'extérieur (cas de la photosynthèse).
La métabonomique visualise tous les métabolites à la spectrographie par résonance magnétique.
Le métabolisme de dégradation de grosses molécules en petites molécules, qui permet la libération d'énergie, est appelé catabolisme. L'énergie est mise en réserve lors de la phosphorylation de l' ADP (adénosine diphosphate) en ATP (Adénosine-triphosphate). Cette énergie servira à assurer les différentes fonctions de la cellule. L'ATP est formé à partir de glucoses, lipides, et protides combinées à l'oxygène. La formation de l'ATP demande une certaine quantité d'oxygène, donc du temps.
Trois modes de fonctionnement existent pour les muscles :
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