La cystéine est un acide-α-aminé naturel qui possède un groupement sulfhydryle ou thiol et qui est présent dans la plupart des protéines, bien que seulement en petites quantités. Sa présence dans des protéines est très importante, notamment parce qu'elle forme des ponts disulfure. Le groupement thiol est très fragile : il s'oxyde très facilement. Son oxydation conduit à la cystine, qui consiste en deux molécules de cystéine unies par un pont disulfure. Une molécule d'eau (H2O) est le produit secondaire de la création de chaque molécule de cystine. Un oxydant plus énergique peut oxyder la cystéine sur son soufre en donnant l'acide cystéique, à l'origine de la taurine (produit de décarboxylation, présent dans la bile sous forme de taurocholate).
Différentes réactions sont utilisés pour « protéger » les thiols des cystéines, ou pour réduire les ponts disulfures, en particulier :
La cystéine peut être prise comme complément alimentaire sous forme de N-acétylcystéine (NAC).
Le génie génétique a réussi a produire des moutons capables de produire leur propre cystine.
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