La Commission européenne est, avec le Parlement européen et le Conseil de l'Union européenne, l'une des trois principales institutions de l'Union européenne. Créée en janvier 1958, elle est composée de 25 commissaires. Son président est, depuis le 22 novembre 2004, le Portugais José Manuel Barroso.
Sa fonction principale est de proposer et de mettre en œuvre les politiques communautaires. En tant que « gardienne des traités », elle veille à leur application. Jouissant d’un monopole de l’initiative, elle joue un rôle central de garante de l’intérêt général. Si le rôle de la Commission a des similitudes avec celui des gouvernements nationaux, il s’en distingue cependant par bien des aspects.
La Commission agit indépendamment des gouvernements des États-membres mais est responsable devant le Parlement qui peut la censurer. Son mandat est de cinq ans. Les commissaires sont assistés par une administration qui est par ses effectifs (17 000 personnes environ en 2001) la plus importante de l’Union. Son siège est situé à Bruxelles dans le bâtiment du Berlaymont.
Cette compétence d’exécution comporte des prérogatives importantes, notamment dans le domaine de la politique agricole commune, ainsi que dans celui de la politique de concurrence, où il lui revient d’autoriser les concentrations et de sanctionner les abus de position dominante et les ententes.
La commission dispose d’un monopole de l’initiative dans le premier pilier qui lui permet de peser dans la formation des actes du Conseil de l’Union et du Parlement. L’article 250 TCE accroît encore l’importance de ce rôle : il stipule que le Conseil de l’Union « ne peut prendre un acte constituant amendement de la proposition que statuant à l’unanimité ». Le Conseil de l’Union ne peut ainsi s’écarter de la proposition de la commission qu’à l’unanimité, ce qui confère parfois à la Commission un rôle de conciliation entre États membres.
Le monopole d’initiative de la commission connaît des limites. Le Parlement et le Conseil de l’Union peuvent demander à la Commission qu’elle légifère dans un domaine. En outre, dans le cadre du deuxième et du troisième pilier, la commission partage le pouvoir d’initiative avec les États membres.
Ensuite, le Conseil adopte à la majorité qualifiée et d’un commun accord avec le président désigné une liste de 25 candidats pour les postes de commissaire (pas plus d’un par État membre). Le collège ainsi formé est soumis à un vote à la majorité qualifiée au Parlement. C’est à cette étape que le collège présenté par Barroso le 12 août a rencontré des résistances sur plusieurs points : Barroso a préféré opérer un remaniement avant le vote, qui est finalement a eu lieu le 18 novembre 2004 (449 pour, 149 contre et 82 abstentions).
Le président de la Commission peut, avec l’approbation du collège, exiger la démission d’un commissaire. Par ailleurs, le Parlement peut adopter à la majorité des deux tiers des voix exprimées et à la majorité de ses membres une motion de censure du collège. C’est pour éviter le vote d’une motion de censure que la Commission Santer a démissionné collectivement dans la nuit du 15 au 16 mars 1999.
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