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Arabidopsis
 

Arabidopsis est un de la des Brassicaceae. Ce sont de petites plantes ressemblant au chou et à la moutarde. Ce genre est d'un grand interet puisqu'il contient Arabidopsis thaliana, l’arabette de Thalius ou arabette des dames, un organisme modèle utilisé pour étudier la biologie végétale.

Étymologie

Latin "arabis": De Arabia, Arabie : plantes croissant souvent dans des terrains secs et sablonneux, comme les déserts d'Arabie." (Flore de Coste) Grec "opsis", aspect : port d'un arabis" (Flore de Fournier)

Reclassification

Actuellement, le Arabidopsis présente neuf s et huit s supplémentaires reconnues. Cette classification est assez récente et est basée sur les études phylogéniques morphologiques et moléculaires de O'Kane & Al-Shehbaz (1997, 2003).

Leurs analyses confirment que les espèces auparavant classées dans le genre Arabidopsis étaient polyphylétiques. La reclassification la plus récente repositionne deux espèces jadis placées dans les genres Cardaminopsis et Hylandra et trois espèces d’Arabis dans le genre Arabidopsis, mais exclut 50 espèces qui ont étés reclassées dans les nouveaux genres : Beringia, Crucihimalaya, Ianhedgea, Olimarabidopsis, Pseudoarabidopsis, ... (voir liste ci-dessous)

Toutes les espèces d’Arabidopsis sont indigènes à l'Europe, alors que deux des espèces ont de vastes aires de répartition s'éténtant également dans l’Amérique du Nord et l’Asie.

Depuis les années 1980, Arabidopsis thaliana s'est élevée au rang d'organisme modèle utilisé dans la communauté scientifique pour les études génétiques et de biologie moléculaire. Cette petite plante présente un petit génome (environ 120 Mb) dont la séquence d'ADN de ces cinq chromosomes est entièrement connue depuis 2000.

Liste des espèces et variantes

  • Arabidopsis arenosa subsp. arenosa
Distribution: Europe: native en Allemagne, Autriche, Biélorussie, Bosnie Herzegovine, Bulgarie, Croatie, République Tchèque, NE France, , Hongrie, N Italie, Latvia, Lithuanie, Macédoine, Pologne, Roumanie, Slovakie, Slovénie, Suisse, Ukraine, et Yougoslavie; naturalisée en Belgique, au Danemark, en Estonie, Finlande, Pays-Bas, Norvège, Russie et Sibérie occidentale, et Suède; absente en Albanie, Grèce, Italie du centre et du sud, et de Turquie.
  • A. arenosa subsp. borbasii
Distribution: Est Belgique, Czech Republic, NE France, Germany, Hungary, Poland, Romania, Slovakia, Switzerland, Ukraine. Doubtfully occurring in Denmark.
Distribution: SE France.
Distribution: Bosnie, Croatie.
  • Arabidopsis halleri subsp. halleri
Distribution: Austriche, Croatie, Republique Tchèque, Allemagne, Italie, Pologne, Romanie, Slovaquie, Slovenie, Suisse, et Ukraine. Probablement introduite en France et éteinte en belgique.
  • Arabidopsis halleri subsp. ovirensis (Wulfen)
Distribution: Albanie, Austriche, NE Italie, Romanie, Slovaquie, Slovenie, SW Ukraine, Yugoslavie.
  • Arabidopsis halleri subsp. gemmifera (Matsumura)
Distribution: Extrème orient Russie, NE Chine, Corée, Japon, and Taiwan.
  • Arabidopsis lyrata subsp. lyrata
Distribution: NE Russie européenne, Alaska, Canada (W Ontario dans la Colombie britannique), SE, C USA.
  • Arabidopsis lyrata subsp. petraea (Linnaeus)
Distribution: Austriche, Republique tchèque, Angleterre, Allemagne, Hongrie, Iceland, Ireland, N. Italie, Norvège, NW Russie, Siberie et extrème orient russe, Ecosse, Swède, Ukraine, Alaska et Yukon. Apparament eteinte en Pologne.
  • Arabidopsis lyrata subsp. kamchatica (Fischer ex D.C.)
Distribution: Alaska boréal, Canada (Yukon, Mackenzie District, British Columbia, NE Saskatchewan), îles Aleutian, E Siberia, extrème orient russe, Corée, N China, Japon, et Taiwan.
Distribution: Carpathes, Pologne, Romanie, Slovaquie, et E Ukraine.
Distribution: NW Italie et probablement éteint en Suisse.
Distribution: Fennoscandinavie et la Baltique.
Distribution: Aurope et Asie centrale, maintenant naturalisé dans le monde entier.

Cytogenetique

Les analyses cytogénétiques ont montré que le nombre haploïde de chromosomes est variable et peut être n = 5, 8, 13, ou 16.

  • Arabidopsis thaliana ; n=5 et la séquence complête d'ADN de cette espèce est connue depuis 2001.
  • Arabidopsis suecica ; n=13 et est une espèce amphidiploïde issue de l'hybridation entre Arabidopsis thaliana et Arabidopsis arenosa.
  • Arabidopsis neglecta ; n=8 comme les nombreuses sous-espèces de A. halleri.

Les nombreuses sous-espèces de A. lyrata et A. arenosa peuvent avoir soit n=8 (diploïde) ou n=16 (tétraploïde).

A. cebennensis, A. croatica and A. pedemontana n'ont pas été analysés au niveau cytologique (en 2005). *

Espèces reclassifiées

Les espèces suivantes jadis placées dans le genre Arabidopsis ne sont actuellement plus considérées comme appartenant à ce genre :

Sources

  • O'Kane Jr, S. L., & Al-Shehbaz, I. A. (1997). A synopsis of Arabidopsis (Brassicaceae): Novon 7: 323–327.
  • Al-Shehbaz, I. A., O'Kane, Steve L. (2002). Taxonomy and Phylogeny of Arabidopsis (Brassicaceae). The Arabidopsis Book: 1-22. online version.
  • O'Kane Jr, S. L., & Al-Shehbaz, I. A. (2003). Phylogenetic position and generic limits of Arabidopsis (Brassicaceae) based on sequences of nuclear ribosomal DNA: Annals of the Missouri Botanical Garden 90 (4): 603-612

Brassicaceae

Arabidopsis | Arabidopsis | Vairenis | Arabidopsis | Arabidopsis

 

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