Das zweite Konzil von Konstantinopel (das fünfte ökumenische Konzil) fand 553 unter dem Vorsitz von Eutychius, Patriarch von Konstantinopel, statt, um gewisse Fragen zu lösen, die aus der Entscheidung des Konzils von Chalkedon entstanden waren - den sogenannten Dreikapitelstreit. Das Konzil, die letzte der fünf großen Kirchenversammlungen der Spätantike, verwarf dabei drei ältere christliche Schriften als im Irrtum befindlich, da sie im wesentlichen nestorianischer Natur seien, ohne jedoch deren Autoren als Ketzer zu bezeichnen. Einberufen wurde es von Kaiser Justinian I., der auch persönlich in die Diskussion eingriff, allerdings nicht selbst anwesend war. Die prominentesten Teilnehmer waren die Patriarchen von Antiochia und Alexandria. Die Zahl der beteiligten Bischöfe aus dem Westen war recht gering, und auch der Papst Vigilius war nicht anwesend, sondern ließ sich wie der Patriarch von Jerusalem durch Legaten vertreten. Der römische Bischof akzeptierte aber alle Beschlüsse des Konzils, auch wenn dies im Westen zu langandauernden Streitigkeiten führte.

Dieses Konzil - eventuell aber auch erst eine kurz darauf stattfindende Anschlussveranstaltung - hat zudem die Idee der Präexistenz der Seele verurteilt, die einst von Origenes und einigen seiner Schüler postuliert worden war. Es hat aber nicht, wie oft fälschlicherweise behauptet wird, die Reinkarnation verurteilt - Reinkarnation wird in den Akten überhaupt nicht erwähnt. Die griechischen Akten des Konzils wurden allerdings 681 vernichtet, da man sie irrtümlich für Fälschungen hielt (!), nur die lateinischen Akten (die in einigen Punkten offensichtlich zugunsten des Papstes manipuliert worden waren) blieben erhalten.

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