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Ligasen (von latein: ligare: verbinden, verketten) sind Enzyme, die das Verknüpfen zweier Moleküle durch eine chemische Bindung katalysieren. Dazu benötigen sie Energie, aus der Spaltung energiereicher Nukleotidtriphosphate (NTP) stammt. Dabei werden 1 oder 2 Phosphatreste abgespalten. Auch andere Moleküle, wie NAD+ können als Energieliferant dienen. Da diese jedoch unter anderem durch ATP-Verbrauch regeneriert werden können, gelten diese Enzyme ebenfalls als "Ligase".

Schematisch verläuft die Ligase-Reaktion folgendermaßen (M1, M2 sind die zu verbindenden Moleküle) ab:

M1 + M2 + NTP → M1-M2 + NDP + P oder M1-M2 + NMP + 2P

Klassifikation


Ligasen werden in der EC-Nummern-Klassifikation mit der Nummer 6 bezeichnet. Ein spezielles Ligase-Enzym hat demnach die Nummer 6.X.X.X. Das zweite X definiert die genauere Art der Verknüpfung:

  • EC 6.1 Verknüpfung von Kohlenstoff und Sauerstoff
  • EC 6.2 Verknüpfung von Kohlenstoff und Schwefel
  • EC 6.3 Verknüpfung von Kohlenstoff und Stickstoff
  • EC 6.4 Verknüpfung zweier Kohlenstoffatome
  • EC 6.5 Bildung eines Phosphoresters
  • EC 6.6 Bildung einer Stickstoff-Metallatom-Bindung

"falsche Freunde" und bedeutende Gruppen


Der Begriff "Ligase" wird häufig synonym für eine spezielle Untergruppe, die DNA-Ligasen verwendet, was aber nicht ganz korrekt ist. DNA-Ligasen verknüpfen (ligieren) zwei DNA-Stränge, indem eine Phosphor-Esterbindung hergestellt wird. Somit gehören DNA-Ligasen in die Klasse 6.5.

Der Begriff "Synthetase" wird ebenfalls häufig synonym gebraucht, ist aber ebenso falsch, da Synthetasen nur ATP und nicht allgemein NTPs verwenden. Synthetasen sollten auch nicht mit Synthasen verwechselt werden, die keine zusätzliche Energie für die Additionsreaktion benötigen.

Eine weitere in der Biochemie bedeutende Gruppe sind die Carboxylasen. Diese Enzyme lagern Kohlendioxid in Form von Karbonationen an andere Moleküle (EC 6.4.1.).

Beispiele


Enzym

Ligase | Ligase | Ligase | Ligaza

 

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