Für weitere Bedeutungen, siehe Iskar (Begriffsklärung).
Die Quelle des Iskars ist der See Tschamowsko (Чамовско езеро) am Nordhang des Rila-Gebirges - 2.500 m ü.d.M. Dieser Ursprungsfluss wird als Rechter Iskar (Прав Искър) bezeichnet - er fließt in den Schwarzen Iskar (Черни Искър). Durch den Zusammenfluss der Flüsse Schwarzer Iskar (Черни Искър), Linker Iskar (Леви Искър) und Weißer Iskar (Бели Искър) - alle noch im Rila-Gebirge - entsteht der eigentliche Fluss. Der Iskar wird durch den Iskar-Stausee gestaut, der 30 km südöstlich von Sofia liegt.
Danach fließt er dicht an Sofia vorbei und durchquert das Balkangebirge in einem engen Tal von Süd nach Nord. Er ist der einzige Fluss, der das Balkangebirge vollständig durchquert.
Der Iskar mündet in der Nähe des Dorfes Gigen (Гиген) in die Donau.
Die Thraker nannten ihn bereits Oescus. An seinen Ufern siedelte der Stamm der Serdier. Oescus war auch ein Ort nahe der Mündung des Iskar, der nach Ptolemaios Oiskoston Triballon hieß und wohl von den thrakischen Triballern gegründet worden war.
Hauptzuflüsse: