Ernst Hafen (* 1956 in St. Gallen) ist Präsident der ETH Zürich.

Hafen studierte in Basel Molekular- und Zellbiologie. Er promovierte 1983 in Entwicklungsbiologie und arbeitete anschliessend am Department of Biochemistry der University of California, Berkeley. Im Jahr 1987 wurde er als Assistenzprofessor ans Zoologische Institut der Universität Zürich berufen, wo er insbesondere Forschung an der Drosophila betrieb.

Er wurde am 1. Dezember 2005 zum Präsidenten der Eidgenössischen Technischen Hochschule Zürich gewählt.

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